JavaScriptでの操作が基本

PCと違い、スマホでは、Audioの機能に制限があるので、JavaScriptで操作することが基本となります。

音源ファイルはMP3だけで問題なし

スマホだけでなく、PCのブラウザでも、MP3さえあれば、ほとんど再生されます。

同時再生について

少し前の機種では、同時に音が再生されませんでした。
iOS6、Android4.1から同時再生が可能になりました。

自動再生について

ユーザーが操作するイベントでしか、音を読み込むことができない。
例えば、サイトにアクセスしたと同時に再生することはできません。
ユーザーの意思による操作が必要だからです。
プリロードすることもできません。

var audio = new Audio('sound.mp3');
var btn = document.getElementById('btn');
btn.addEventListener('click', function() {
    audio.play();
}, false);

ループは自分で

スマホではloop属性が効かないので、自分で実装します。

audio.addEventListener('ended', function() {
    this.currentTime = 0;
    this.play();
});

再生中の再生について

私の環境では、はっきり現象が確認できていないですが、Androidでは、再生中に最初から再生させるとき（ボタンのタップ音などで使う想定）、再度new Audio()しないと駄目なものがあるようです。

音量は本体で変更する

音量の操作は、スマホ本体で行うようになっており、JavaScriptなどで変えることができません。

非表示中の再生について

最近のバージョンでは、再生中にブラウザを非表示にしても、再生し続けてしまいます。
BGMのように、ずっと再生している場合、非表示のときに止まるようにしてあげましょう。

document.addEventListener('visibilitychange', function(){
    if (document.visibilityState === 'hidden'){
        audio.pause();
    }else if(document.visibilityState === 'visible'){
        audio.play();
    }
}, false);

※クロスブラウザ対応の場合、visibilitychangeの機能が使えるかどうか、判定して実装してください。